各位老师好: 我已经用rest处理得到了配对t检验的t-map文件,格式是”.nii”,然后用Slice View可以读取,也可以看cluster。但是我想看每个cluster里面除了peak点以外的t值比较大的点的坐标和t值,请问要怎么才可以得到这样的t值和坐标的table呢????
ZHANG_RESTadmin
Mon, 01/21/2013 - 17:35
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严老师可能更清楚如何得到次大和第三大的peak值。 如果我来做的话,我会用spm来做paired t test,然后用spm来看结果,或者用xjview来看结果(基于spm的result table)
flyinghonghong
Fri, 01/25/2013 - 00:24
非常感谢各位老师的解答, 我后来确实也是用了spm来做ttest,然后找的table中peak值比较大,且在cluster中点,这样也能找到次大和第三大的点等~~部分上能解决这个问题~
YAN Chao-Gan
Tue, 01/29/2013 - 17:39
:) 我也赞成这是目前最方便的方法。
Wed, 01/30/2013 - 01:44
O(∩_∩)O~谢谢超赣师兄~~~
ZangYF
Thu, 01/24/2013 - 23:29
我觉得没有几个软件支持这个功能。关键问题是,如何定义“t值比较大的几个体素”。或者,你猜测一个大的cluster内,可能有多个小的cluster,这样,就会出现多个“亚”peak?如果是这个问题,倒是有一些方法,但大家并不是很关注。比如,你或许可以试试提高阈值,看能否将cluster分开。在AFNI中,有一些方法,比如,如果两个cluster相连,可以用一个erode的方法解决。watershed也是解决这个问题的好方法,但我不知道哪个软件支持这个功能。
Fri, 01/25/2013 - 00:26
恩,非常感谢藏老师
ZHANG_RESTadmin
Mon, 01/21/2013 - 17:35
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Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
严老师可能更清楚如何得到次大和第三大的peak值。
如果我来做的话,我会用spm来做paired t test,然后用spm来看结果,或者用xjview来看结果(基于spm的result table)
flyinghonghong
Fri, 01/25/2013 - 00:24
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Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
非常感谢各位老师的解答, 我后来确实也是用了spm来做ttest,然后找的table中peak值比较大,且在cluster中点,这样也能找到次大和第三大的点等~~部分上能解决这个问题~
YAN Chao-Gan
Tue, 01/29/2013 - 17:39
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Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
:) 我也赞成这是目前最方便的方法。
flyinghonghong
Wed, 01/30/2013 - 01:44
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Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
O(∩_∩)O~谢谢超赣师兄~~~
ZangYF
Thu, 01/24/2013 - 23:29
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Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
我觉得没有几个软件支持这个功能。关键问题是,如何定义“t值比较大的几个体素”。或者,你猜测一个大的cluster内,可能有多个小的cluster,这样,就会出现多个“亚”peak?如果是这个问题,倒是有一些方法,但大家并不是很关注。比如,你或许可以试试提高阈值,看能否将cluster分开。在AFNI中,有一些方法,比如,如果两个cluster相连,可以用一个erode的方法解决。watershed也是解决这个问题的好方法,但我不知道哪个软件支持这个功能。
flyinghonghong
Fri, 01/25/2013 - 00:26
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Re: rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?
恩,非常感谢藏老师